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[openmx:openmx.git] / src / omxStateSpaceExpectation.h
1 /*
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3  *
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6  *  You may obtain a copy of the License at
7  *
8  *       http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
9  *
10  *   Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
11  *   distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
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13  *  See the License for the specific language governing permissions and
14  *  limitations under the License.
15  *
16  */
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18 #ifndef _OMXSTATESPACEEXPECTATION_H_
19 #define _OMXSTATESPACEEXPECTATION_H_
20
21 typedef struct {
22         omxMatrix *cov, *means;
23         omxMatrix *A, *B, *C, *D, *Q, *R; // State Space model Matrices
24         omxMatrix *r, *s, *u, *x, *y, *z; // Data and place holder vectors
25         omxMatrix *K, *P, *S, *Y, *Z; // Behind the scenes state space matrices (P, S, and K) and place holder matrices
26         omxMatrix *x0, *P0; // Placeholders for initial state and initial error cov
27         omxMatrix *det; // Determinant of expected ccovariance matrix S
28         
29 } omxStateSpaceExpectation;
30
31
32 void omxKalmanPredict(omxStateSpaceExpectation* ose);
33 void omxKalmanUpdate(omxStateSpaceExpectation* ose);
34
35 void omxInitStateSpaceExpectation(omxExpectation* ox, SEXP rObj);
36
37 omxMatrix* omxGetStateSpaceExpectationComponent(omxExpectation* ox, omxFitFunction* off, const char* component);
38
39 void omxSetStateSpaceExpectationComponent(omxExpectation* ox, omxFitFunction* off, const char* component, omxMatrix* om);
40
41
42 #endif /* _OMXSTATESPAACEEXPECTATION_H_ */